Ο Σπύρος Παυλίδης είναι συγγραφέας των εξής βιβλίων:
Χρόνια Πολλά Δαρβίνε. "Ενας Βιολόγος και ένας Γεωλόγος συζητούν ... με τον Δαρβίνο... για τον Δαρβίνο... και το Δαρβινισμό" (σε συνεργασία με τον καθ. Χαρίτων Σ. Χιντήρογλου). Εκδόσεις: UNIVERSITY STUDIO PRESS, Θεσσαλονίκη 2012.
Παν-γαία. Μία διαφορετική βιο-γεωλογική διαδρομή στον πλανήτη Γη. Εκδόσεις: Leader Books. Θεσσαλονίκη 2007.
Γεωλογία των Σεισμών: Εισαγωγή στη Νεοτεκτονική και Παλαιοσεισμολογία. Εκδόσεις: UNIVERSITY STUDIO PRESS, Θεσσαλονίκη 2003 και β’ έκδοση βελτιωμένη 2016.
Νεοτεκτονική: Εισαγωγή στη μελέτη των πρόσφατων γεωλογικών δομών. (Σε συνεργασία με τον Καθ. Δημοσθένη Μουντράκη). Εκδόσεις: UNIVERSITY STUDIO PRESS, Θεσσαλονίκη 1986.
Γεωσύστημα ‘ΓΑΙΑ‘: Κατανοώντας τη δομή και τη λειτουργία του πλανήτη μας (Συνσυγγραφέας Αλάξανδρος Χατζηπέτρος). Εκδόσεις Liberal Books, 2018.
Χρόνια Πολλά Δαρβίνε. "Ενας Βιολόγος και ένας Γεωλόγος συζητούν ... με τον Δαρβίνο... για τον Δαρβίνο... και το Δαρβινισμό" (σε συνεργασία με τον καθ. Χαρίτων Σ. Χιντήρογλου). Εκδόσεις: UNIVERSITY STUDIO PRESS, Θεσσαλονίκη 2012.
Παν-γαία. Μία διαφορετική βιο-γεωλογική διαδρομή στον πλανήτη Γη. Εκδόσεις: Leader Books. Θεσσαλονίκη 2007.
Γεωλογία των Σεισμών: Εισαγωγή στη Νεοτεκτονική και Παλαιοσεισμολογία. Εκδόσεις: UNIVERSITY STUDIO PRESS, Θεσσαλονίκη 2003 και β’ έκδοση βελτιωμένη 2016.
Νεοτεκτονική: Εισαγωγή στη μελέτη των πρόσφατων γεωλογικών δομών. (Σε συνεργασία με τον Καθ. Δημοσθένη Μουντράκη). Εκδόσεις: UNIVERSITY STUDIO PRESS, Θεσσαλονίκη 1986.
Γεωσύστημα ‘ΓΑΙΑ‘: Κατανοώντας τη δομή και τη λειτουργία του πλανήτη μας (Συνσυγγραφέας Αλάξανδρος Χατζηπέτρος). Εκδόσεις Liberal Books, 2018.